更新时间:2024/01/01
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难度系数:★☆☆☆☆
Linux操作系统下,SPONGE及配套软件(Xponge、VMD)的安装
难度系数:★☆☆☆☆
Windows操作系统下,SPONGE及配套软件(Xponge、VMD)的安装
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通过Xponge对包含有ATP、LAB配体,MG离子的4B1Y蛋白质体系建模
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通过Xponge对高分子材料进行建模,以gaff力场的聚乙二醇为例
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通过Xponge建模->SPONGE模拟->VMD可视化,进行隐式溶剂下的丙氨酸十二肽折叠的模拟
难度系数:★★☆☆☆
通过Xponge建模->SPONGE模拟->VMD可视化,进行40GPa下氯化钠晶体的模拟
难度系数:★★★☆☆
使用伞形抽样、metadynamics和SITS对过氧化氢二面角进行增强抽样