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本页对应的源文档快照。

PME 静电参数

当前源码通过 PM 模块初始化 PME，因此新的 TOML 示例优先使用 [PM] 分组：

[PM]
grid_spacing = 1.0
Direct_Tolerance = 1e-5
MPI_size = 1
print_detail = false

部分 PME 控制参数仍从兼容分组 [PME] 读取。这是源码中的参数读取方式，并不代表另一种算法。

[PM] 参数

参数	所属分组	类型	默认值	说明
fftx	PM	int	自动	X 方向 FFT 网格数
ffty	PM	int	自动	Y 方向 FFT 网格数
fftz	PM	int	自动	Z 方向 FFT 网格数
grid_spacing	PM	float	1.0	网格间距，单位 Å
Direct_Tolerance	PM	float	1e-5	Ewald 实空间误差容限
MPI_size	PM	int	controller 中的值	PME 进程数
print_detail	PM	bool	false	输出详细的 PME 能量分项

若省略 fftx、ffty、fftz，SPONGE 根据 grid_spacing 和当前盒子尺寸自动确定网格数。

即使存在此参数，当前源码仍拒绝 MPI_size > 1。

[PME] 兼容参数

当前源码从 [PME] 分组读取以下参数：

参数	所属分组	类型	默认值	说明
update_interval	PME	int	1	倒空间更新间隔
calculate_reciprocal_part	PME	bool	true	是否计算 PME 倒空间部分
calculate_excluded_part	PME	bool	true	是否计算排除原子对的 PME 项
replaced_by_PMC_IZ	PME	bool	false	用 PMC-IZ 替代 PME 倒空间计算

replaced_by_PMC_IZ = true 不能用于 npt 模式。