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约束算法参数

约束模式

参数	类型	默认值	说明
constrain_mode	string	无，禁用约束	约束算法

constrain_mode 可选值：

取值	说明
"SETTLE"	专用于刚性水分子的 SETTLE 算法（三角形约束）
"SHAKE"	通用键长约束 SHAKE 算法

基本约束列表通过 [constrain] 前缀配置：

constrain_mode = "SHAKE"

[constrain]
mass = 3.3

SETTLE 参数

参数	类型	默认值	说明
settle_disable	bool	false	顶层开关，完全禁用 SETTLE

SHAKE 参数

参数	所属分组	类型	默认值	说明
iteration_numbers	SHAKE	int	25	最大迭代次数
step_length	SHAKE	float	1.0	步长／阻尼因子

[constrain] 参数

参数	所属分组	类型	默认值	说明
in_file	constrain	string	-	额外键约束列表文件
mass	constrain	float	3.3；设置 in_file 时为 0.0	自动约束涉及质量低于此阈值原子的键
angle	constrain	bool	false	保留参数，目前未实现