SPONGE 1.4 安装

01 · 主程序

SPONGE 源码下载

SPONGE 1.4 稳定版本的源码包,含标准 MD 与 TI 程序。

02 · 前后处理

Xponge 安装

Xponge 是用 Python 编写的 SPONGE 前后处理工具。

通过 PyPI 安装 pip install Xponge PyPI

03 · 可视化

VMD 可视化插件安装

插件让 VMD 能直接读取 SPONGE 输出的轨迹与拓扑文件。使用方法见压缩包中的 README。

04 · 运行时接口

prips 安装

prips 是 SPONGE 配套的 Python 运行时接口插件(Python Runtime Interface Plugin of SPONGE)。

通过 PyPI 安装 pip install prips PyPI