Xponge主要功能为产生CudaSPONGE所需的分子动力学模拟初始输入
Xponge附带一定的前后处理功能
Xponge能够为复杂的分子动力学模拟产生自动化工作流
Xponge能够为提供一定的通用分子处理功能
使用pip进行安装: pip install Xponge
pip install Xponge
CudaSPONGE的VMD插件可以使VMD将CudaSPONGE的构象和轨迹进行可视化
点击下方的链接下载,然后按照内部的README.md进行安装 sponge_vmd 1.4.3版本